Бывший глава «Роснано» Анатолий Чубайс в марте 2022 года направил Владимиру Путину письмо с критикой вторжения в Украину и требованием немедленно прекратить боевые действия. Об этом говорится в докладе спецдокладчицы ООН по правам человека в России Марианы Кацаровой, представленном Генассамблее. Сам Чубайс в разговоре с «Эхом» подтвердил, что письмо действительно написал.
Документ под названием «„Предатели Родины“: стратегия запугивания и наказания, применяемая Российской Федерацией для подавления инакомыслия внутри страны и за рубежом» опубликован 15 октября под номером A/81/374. Преследование бывших руководителей «Роснано» в нём рассматривается как пример политически мотивированного давления на предпринимателей.
О существовании письма Путину с требованием прекратить войну ранее широко не сообщалось. О том, что Чубайс покинул пост спецпредставителя президента, стало известно 23 марта 2022 года: тогда Reuters со ссылкой на два источника сообщил, что он ушёл из-за несогласия с вторжением. Дмитрий Песков подтвердил отставку, заявив, что чиновник уволился по собственному желанию. Указ об освобождении от должности Путин подписал 25 марта. Публично с развёрнутым осуждением вторжения Чубайс в 2022 году не выступал.
Как установил The Insider, сопоставив даты, уже 24 марта 2022 года новый руководитель «Роснано» Сергей Куликов направил генпрокурору Игорю Краснову письмо с просьбой проверить деятельность корпорации в 2010–2020 годах, когда ею руководил Чубайс. Это произошло на следующий день после сообщений о его отъезде и за день до подписания указа об отставке. В обращении Куликов ссылался на финансовые проблемы корпорации: по его данным, за время прежнего руководства «Роснано» привлекло более 290 млрд рублей внешних заимствований, к концу 2020 года задолженность перед банками превышала 146 млрд рублей, а расходы на обслуживание долга в 2010–2021 годах составили около 126 млрд рублей.
Согласно докладу ООН, уголовные обвинения предъявлены как минимум 22 людям, связанным с «Роснано». Против бывших руководителей и сотрудников корпорации также поданы гражданские иски. В мае Чубайс сообщал, что общий объём предъявленных требований превысил 25 млрд рублей.
В апреле бывший топ-менеджер Борис Галкин получил девять лет колонии. В сентябре аналогичный срок назначили бывшему управляющему директору Андрею Кушнареву по делу о растрате более 7,5 млрд рублей при создании производства микросхем. Бывшего управляющего директора Ирину Рапопорт заочно приговорили к 15 годам колонии по делу о растрате около 1,6 млрд рублей. Ранее The Insider писал, что суд взыскал с бывших топ-менеджеров 11,9 млрд рублей по делу Crocus, а по делу Plastic Logic — более 5,5 млрд рублей.
В мае Чубайс назвал уголовные дела против бывших сотрудников «Роснано» репрессиями и издевательством над законом, а новое руководство корпорации — «рейдерской конторой». Обвиняемые ранее тоже связывали свои дела с его отказом возвращаться в Россию.
В январе 2025 года депутаты Госдумы Андрей Картаполов и Андрей Луговой обратились в Следственный комитет и Генпрокуратуру с требованием проверить деятельность Чубайса. Луговой назвал его предателем. В докладе ООН отдельно упоминается, что британские власти считают Лугового причастным к отравлению Александра Литвиненко в Лондоне в 2006 году: публичное расследование установило, что Луговой и Дмитрий Ковтун осуществили отравление, вероятно действуя под руководством ФСБ.
В августе власти Канады исключили Чубайса из своего санкционного списка после его обращения в Федеральный суд. В заявлении он называл себя историческим противником Путина и утверждал, что с 2022 года находится в добровольном изгнании из-за несогласия с войной.