Дарья Шипилова, лаборантка Иркутского научно-исследовательского противочумного института Сибири и Дальнего Востока, попала в больницу в конце сентября и умерла 2 октября. Роспотребнадзор заявил, что причиной смерти стала «пневмония неустановленной этиологии», а связанных с её работой микроорганизмов не обнаружили. Ведомство также заявило, что не нашло аварийных ситуаций при работе с патогенными микроорганизмами в институте.
Несмотря на это, в Иркутске ввели карантин в нескольких больницах. По данным «Людей Байкала», в Иркутской городской клинической больнице №1 и Ивано-Матренинской детской клинической больнице к пациентам не пропускают родных, а находящимся внутри людям не разрешают выходить. Местные СМИ сообщают о карантине также в больницах №3 и №10 и как минимум в одном роддоме. По информации «Людей Байкала», на карантин поместили около 200 человек, с которыми Шипилова могла контактировать.
По данным Сибирь.Реалий, более 60 сотрудников института изолировали в здании на улице Трилиссера, 78. Родственник одного из работников рассказал изданию, что людей заперли с пятницы, они спят на полу и на стульях, передачи с продуктами пропускают через КПП. Пациентка ГКБ №1 сообщила Сибирь.Реалиям, что персонал находится на бессрочной смене, пока не будут готовы результаты анализов.
На Иркутском алюминиевом заводе в Шелехове третьего октября ввели масочный режим. Директор предприятия Артём Фоминых назвал эту меру профилактической и написал, что по Шелехову распространяется противоречивая информация о ситуации с чумой. Местные жители, по данным Дождя, заметили на улицах людей в защитных костюмах, масках и перчатках.
В Иркутск приехала руководитель Роспотребнадзора, главный государственный санитарный врач России Анна Попова. Она приняла участие во внеочередном заседании областной санитарно-противоэпидемической комиссии, которое созвали из-за подозрения на «особо опасную инфекцию». На заседании утвердили оперативный план действий, а Роспотребнадзор сообщил о полном комплексе противоэпидемических мероприятий.
Глава Бурятии Алексей Цыденов первым из высокопоставленных чиновников прямо употребил слово «чума» в связи со смертью Шипиловой. По одной из неофициальных версий, незадолго до болезни она якобы побывала в Бурятии. Цыденов написал, что женщина не приезжала в республику, и опроверг сообщения о возможном очаге заболевания. Позже он отредактировал публикацию, добавив формулировку «женщина, возможно, погибшая от чумы».
Издатель журнала «Люди Байкала» Елена Трифонова рассказала в эфире Дождя, что власти до сих пор не признают вспышку. По её словам, иркутские врачи «уже открыто говорят о чуме», однако в официальных документах этот диагноз не фигурирует. Трифонова отметила, что родственникам тело Шипиловой не отдали и вскрытие на тот момент не производили.
Администрация Байкальска 3 октября призвала жителей временно не ездить в Шелехов и соседние населённые пункты, но позднее удалила пост. Администрация Шелехова также опубликовала призыв воздержаться от поездок в город, который затем был удалён.
Пресс-секретарь Владимира Путина Дмитрий Песков назвал Роспотребнадзор компетентным ведомством и призвал ориентироваться на его заявления, не став обсуждать инцидент. ТАСС со ссылкой на Роспотребнадзор сообщил о стабильной санитарно-эпидемиологической обстановке в регионе.
Белый дом следит за сообщениями о возможной вспышке чумы в Иркутской области. Представитель администрации США сообщил Axios, что администрация «в курсе, следит за вспышкой и оценивает варианты». Дональд Трамп заявил, что США готовы помочь России, и отметил, что не связывался с российскими властями по этому поводу.
Казахстан и Кыргызстан усилили санитарно-карантинный контроль на границах, Узбекистан перевёл в повышенную готовность службы, предотвращающие завоз инфекций. Минздрав Азербайджана заявил, что не видит необходимости в усилении таможенного контроля.
Источники расходятся: Роспотребнадзор утверждает, что Шипилова умерла от «пневмонии неустановленной этиологии» и аварий при работе с патогенами не было. По данным «Людей Байкала» и Сибирь.Реалий, врачи говорят о чуме, а Шипилова, по версии «Людей Байкала», разбила пробирку с возбудителем. Роспотребнадзор эту версию опроверг.