Карточку журналиста в базе МВД заметила «Медиазона». По какой именно статье его разыскивают, не сообщается.
Ковалев возглавлял отдел расследований «Медузы» с 2019 по 2022 год. До этого сотрудничал с ИноСМИ.ру, где был главным редактором, а также с Wired, GQ и The Guardian. Трижды получал журналистскую премию «Редколлегия» — за материалы о коррупции в администрации мэра Москвы Юрия Лужкова, о «дворце Путина» под Геленджиком и о военных преступлениях российских военных в Украине.
После начала полномасштабного вторжения России в Украину Ковалев уехал из страны — по данным Радио Свобода, это произошло 4 марта 2022 года. За границей он занялся работой с открытыми данными для Фонда справедливости Клуни, который занимается защитой журналистов и мониторингом нарушений прав человека.
В 2025 году Ковалев опубликовал расследование о том, как в оккупированном Мариуполе жилье погибших и уехавших жителей признают «бесхозным» и передают государству или перепродают. В описании проекта говорится, что преступления России в Мариуполе не прекратились вместе с обстрелами жилых кварталов и теперь это другие военные преступления — «куда менее заметные и сильно растянутые во времени».
В декабре 2024 года Минюст внес Ковалева в реестр «иностранных агентов». В 2025 и 2026 годах на него дважды составляли административные протоколы о несоблюдении «иноагентских» требований.